长江三峡工程是人类在自然界中一项巨大的造物行为，其目的是为了改善人类生存和可持续发展的未来。工程改变了长江及长江流域原有的环境和生态，对其利与弊，不仅要运用现代科技予以兴利除弊，更要用哲学思维加以分析思考。
三峡工程是开发和治理长江的关键性骨干工程，具有防洪、发电、航运等巨大的经济和社会效益。工程建设采用“一级开发、一次建成、分期蓄水、连续移民”的建设方案，分3个阶段施工，总工期17年。自1993年开始步入工程实施阶段，1994年12月正式开工，2003年6月水库蓄水到135米高程，三峡工程开始发挥初期的综合效益。2006年10月，三峡水库已实现初期蓄水156米高程，左岸电站14台共980万千瓦机组提前一年投产发电，大坝提前两年挡水初步发挥防洪效益。整个工程将于2009年全面竣工。
长江三峡工程由于规模巨大、问题复杂，一直是正反方面有争议的工程，必须以科学的态度、用科学的方法加以探索分析，揭示事物的本质，用哲学的办法来进行思辨，以此来指导我们的行为，以取得预期目标的可持续性，并有利于未来的发展。
“我思故我在”和“我造物故我在”是两句哲学箴言。“思”与“造物”是人类不可分割的完整的活动全过程。人类在自己生存和发展的环境中不断地实践、不断地思维、不停地造物，也创造了人类自己，也就是“实践认识再实践再认识”，由初级的思维到高级的思维，由简单的造物到复杂的工程造物，永无止境，这就是人类的本质。没有无思的造物，也没有不造物的思维。什么是工程哲学？工程哲学能够理解为对工程的认识，对工程造物的思辨。
长江三峡工程是自然和人类社会巨系统中的一个复杂系统工程，它涉及到长江和长江流域的自然生态、人文环境、政治、经济以及工程本身的建设技术和基础科学的复杂问题。长江三峡工程中值得思考的问题很多，例如三峡工程建设与生态和环境的关系问题、长江洪水灾害及其对策问题、三峡水库移民搬迁和重建家园脱贫致富问题、是否可能以“蓄清排浑”的调度方式协调水沙关系的问题、如何保护长江及三峡水库水质的问题、如何保护三峡水库水生物的良好生态和发展渔业问题、如何正确认识三峡水库的地质构造采取比较有效措施防止地质灾害问题、如何采取比较有效措施确保长江三峡工程安全问题、如何充分的利用长江三峡水能资源改善环境问题、怎么样做科学系统的管理确保三峡工程建设项目实施成功的问题等等。这些都是十分重要而复杂的问题，不但需要从科学、技术、经济、生态、社会等角度做多元化的分析和研究，而且需要从哲学角度做多元化的分析和思考，一定要通过认真、深入的分析思考努力取得科学精神与人文精神的统一。
从哲学的角度看三峡工程，人们对它的认识不可能一步到位，就是在工程全部竣工后，在运行过程中仍然需要长期的实践，遵循“实践认识再实践再认识”的规律，在实践中检验真理。
长江三峡工程如同其他工程造物活动一样，一定要经过严格的3个阶段的管理，才能实现预期的工程目标。
第一阶段是思维决策阶段。这一阶段实质上是思维成熟的过程，通过广泛、深入的调查研究、科学实验、设计论证，准确地认识自然和客观世界的方方面面，揭示事物的本质，在这些基础上完成决策程序。这一阶段的管理在方法上一定要坚持科学化和民主化的原则，广泛听取各类不同的意见，切忌主观和片面性。三峡工程的最终论证分设了14个专题，由412位资深专家组成的专家组对14个专题进行了科学、翔实的论证，得出的总结论是：三峡工程在技术上是可行的、在经济上是合理的，建比不建好，早建比晚建好，建议早作决策。长江三峡工程经历了几代中国人不断的探索，70余年的历程，才于1992年完成了决策程序。
第二阶段是工程的实施阶段，三峡工程本身规模宏大，涉及自然和社会的众多方面，是自然和人类社会巨系统中的一个复杂系统，必须用系统工程控制论的理念和方法实施管理。现在预测三峡工程的进度可完全控制在预定计划内，而各项效益的发挥比预期的进度提前了一年实现。国家批准的按1993年5月物价水平的三峡工程概算是900.9亿元（其中400亿元用于移民），考虑总工期17年过程中银行贷款利息和物价变动因素，原来预测的最终造价为2039亿元。至2006年底，整个工程已完成了85%以上，动态投资约完成1304亿元。根据剩余的工程量和预测的未来资金需求，最终总造价能控制在1800亿元以内。
第三阶段是运行经营阶段，本质上是全面达到整个工程建设项目的预期效益目标的阶段，是要通过运行经营的管理来实现的。通过科学的管理、严密的组织和严格的制度实现高效、有序的管理，使工程发挥出最大的社会效益和经济效益。
长江三峡工程是时间、历史和人的智慧的共同结果，是人在大自然中的造物过程。长江三峡工程是一个科学的理性的工程，规模大、工期长，从思想和认识方面看，它既集中而又广泛地反映和凝结了人类在自然科学、社会科学、技术科学、工程科学、工程技术、工程设计、工程管理、工程项目施工、工程经济和其他许多有关领域和方面的知识和智慧。从哲学上看，我们承认作为客观存在的自然界和人类社会是可知的，实际上，工程造物活动就是建立在“可知论”的思想基础之上的。但“可知论”绝不等于“全知论”，我们清醒地认识到人类在任何一个“时间点”上的认识能力和认识水平都是有一定局限性的。可是，这种局限性又是可以随人类实践的进展而不断突破的，人类的认识是无穷无尽、无止境的。三峡工程的建设者对三峡工程的认识和实践并没结束。历史在前进，人类的认识和实践都在发展。只有在实践中不断深化和提高人类的认识能力，人类的工程能力才能逐步的提升、工程理念才能不断升华，工程与自然和社会的关系才能在愈来愈和谐的道路上不断前进。